Протистояння  між Ющенком та Тимошенко почалося не за керівництва Віктора Балоги в Секретаріаті Президента. А ще у вересні 2005 року, коли Глава держави відправив тодішню прем’єр-міністра у відставку. Про це лідер Єдиного Центру заявив в інтерв’ю газеті «День», відповідаючи на запитання про те, що саме він започаткував «холодну війну» проти очільниці Уряду і це стало результатом падіння рейтингу Віктора Ющенка.  

«Треба  чітко розуміти, що майже три роки на Банковій я працював на Президента, а не навпаки. Усілякі порівняння мене з «сірим кардиналом» не приймаю. Моя діяльність на тодішній посаді, як і всього Секретаріату під моїм керівництвом, була публічною, рішення оголошувалися відкрито і були широко відомі ЗМІ і громадськості. Зрештою, чомусь забувають, що Банкова не менш гостро критикувала багато рішень уряду Януковича. Мабуть тому, що він не переводив критику в особисту площину».  

В.Балога зауважив, що Тимошенко не спростувала  жодну тезу з офіційних заяв Секретаріату. «Хто зараз продовжує вважати, що ми купуємо російський газ за прийнятну  ціну? Однак, коли Банкова з цифрами і фактами доводила, що газовий контракт із Росією вкрай невигідний для України, Прем’єр казала про угоду як про перемогу».